Согласно порталу GoNintendo, японская версия Sonic Chronicles: The Dark Brotherhood, получившая название Sonic Chronicles: Invaders from the Dark Dimension, в первую неделю продаж в стране Восходящего Солнца разошлась тиражом в 2100 копий. Причины провала «Хроник» в Японии, по мнению сайта TSSZ news, — отсутствие рекламной кампании: у местной аудитории не было информационных источников об игре, кроме официального сайта. Релиз локализованной версии Sonic Chronicles в Японии состоялся почти спустя год после выхода игры в Европе и Северной Америке.